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ferjusa.
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Ciao a tutti!
Vorrei la nostra opinione sull'approccio da seguire per un esperimento di sequenziamento con la ION torrent, un sequenziatore di seconda generazione,in grado di leggere sequenze fino a 200 pb.
L'idea è sequenziare il genoma del virus HCV (9000 bp circa) o almeno 3 suoi geni (ognuno di circa 1500 pb).
Come conviene frammentare il DNA in sequenze più piccole? Quali potrebbero essere le metodiche da seguire? Evitando la sonicazione, la frammentazione enzimatica in cosa consiste? E come è meglio disegnare i primers?
Grazie mille!!!.
frammentazione DNA e Next generation sequencing |