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lenka.
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Ciao a tutti, gentilmente, mi aiutereste a risolvere questo esercizio, non ne ho mai fatto uno del genere... grazie mille 
I tre geni recessivi an, br, f sono situati tutti nel cromosoma 1 del granturco. Quando una pianta eterozigote per questi marcatori viene reincrociata con una pianta omozigote recessiva, si ottengono i seguenti risultati:
progenie derivante
dal reincrocio
+++ 88
f 21
br 2
br f 339
an 355
an f 2
an br 17
an br f 55
totale 879
Determinare la sequenza di questi tre geni e le loro distanze sulla mappa.
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M111.
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Io gli ho sempre fatti con la tabella, praticamente da li potevo arrivare ai ricombinanti br e an, br e f, an e f, controllando anche i doppi ric....
Tu il testo l'hai in tabella e hai riassunto così? oppure questo è il tuo testo?
Vista così non sono bravo ad orientarmici, però potrei dirti in ordine br, an, f; tra br e an 1.9 e tra an e f 0.22, solo che generalmente la somma non torna di poco per la presenza dei doppi ric, qua invece la somma varia di molto; quindi probabilmente ho capito male..... -
lenka.
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Ciao M111, grazie della risposta. Si, il testo e proprio quello, anche se avevo scritto un po troppo attaccate le lettere con i numeri… non riesco a capire dove sono andati a finire altri geni che determinano il genotipo nella progenie, come mai nella prima riga ce ne stanno tutti e tre e poi nella seconda solo uno e cosi via… (?) comunque la soluzione dovrebbe essere= sequenza br f an con la distanza di 4.7 um tra br f, e di 16.7 tra f an. . -
M111.
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...quelli sono gli indispensabili riferimenti per gli eventi di ricombinazione; domani te lo riguardo, prtroppo ora mi ha colpito un mal di testa incredibile.... . -
lenka.
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Spero che il mal di testa ti sia gia passato... 
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M111.
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In tutta sincerità, me l'ero dimenticato
Rileggendolo mi viene in mente una cosa...potrebbero non essere i numeri di eventi di ricombinazione, ma alcuni dati potrebbero esser di numero di frammenti recuperati e marcati...
però a questo punto mi servirebbero i dati distinti di selected e unselected marker...
Onestamente ho dei problemi nel risolverlo, quindi ho dei problemi con questo punto di programma, devo studiare meglio spero di riuscire a risolverlo il prima possibile
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lenka.
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, io pensavo che era il numero degli individui con quel fenotipo... mah
comunque e importante che il mal di testa e passato. -
mike86_212.
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CITAZIONE (lenka @ 25/1/2009, 17:00)Ciao M111, grazie della risposta. Si, il testo e proprio quello, anche se avevo scritto un po troppo attaccate le lettere con i numeri… non riesco a capire dove sono andati a finire altri geni che determinano il genotipo nella progenie, come mai nella prima riga ce ne stanno tutti e tre e poi nella seconda solo uno e cosi via… (?) comunque la soluzione dovrebbe essere= sequenza br f an con la distanza di 4.7 um tra br f, e di 16.7 tra f an.
Domani l'ho proprio l'esame di Genetica. Ho provato a fare l'esercizio e viene proprio così... Confermo!
E' un normale incrocio di controllo a tre punti!. -
M111.
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Dici che mi sono fatto troppi problemi eh
Quindi le informazioni in più che da è ridondanza di confusione? Bene, ma allora perchè la somma si distacca di così tanto da quella che dovrebbe essere dai dati?
Quello mi ha fatto pensar male dall'inizio.... -
lenka.
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mike? mi fai vedere come l hai fatto? anche se e un normale incrocio di controllo a tre punti... come se ci fosse qualcosa che non va...
in bocca al lupo domani. -
mike86_212.
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Allora... Io vado per punti.
Parto col stabilire qual è la progenie più rappresentata, quindi i parentali, che non subiscono ricombinazione, quindi
+ br f an + +
Poi stabilisco la progenie meno rappresentata, cioè chi subisce i doppi crossing over:
an + f + br +
In terza istanza stabilisco l'ordine dei geni, partendo dal parentale più rappresentato (di solito è l'eterozigote, ma non in questo caso)!
an + +//+ br f
Faccio i doppi crossing over in modo da ottenere tre combinazioni:
1) an br +//+ + f
2) + + +//br an f
3) an f +//+ + br
La combinazione esatta è la terza
quindi l'ordine dei geni è an f br
Riscrivo la progenie con il corretto ordine dei geni e infine calcolo le frequenze di ricombinzione che ci sono tra an f e tra f br.
Non so se hai capito, qui è un po difficile spiegare, ma è un normalissimo incrocio a tre punti!
Crepi il lupoooooooo. -
lenka.
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si ho capito 
grazie per la spiegazione
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M111.
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Ovviamente hai ragione, la cosa positiva è che ho imparato a farli senza le tabelle con i marcatori, grazie mille per il tuo intervento... .
esercizio geneticadistanze di mappa, sequenza di geni |